Vankoningsveld, Lauren M. K., Richard W. McLaughlin & Durward L. Bevis (2026): An analysis of the bacterial and fungal diversity of the fecal material of gopher tortoises. – microPublication Biology 002029.
Eine Analyse der Bakterien- und Pilzdiversität in den Kotproben von Gopherschildkröten.
DOI: 10.17912/micropub.biology.002029 ➚
Gopherus polyphemus,
© Tracey D. Tuberville
Die Gopherschildkröte (Gopherus polyphemus) ist im Bundesstaat Florida als gefährdete Art gelistet. Es ist allgemein bekannt, dass die Mikrobiota des Wirts für die Gesundheitsförderung und die Eindämmung von Krankheiten von entscheidender Bedeutung ist. Die Vielfalt der Darmmikrobiota der Schildkröte wurde bislang noch nicht umfassend untersucht. In dieser Studie untersuchten wir sowohl die bakterielle als auch die pilzliche Vielfalt im Kot dieses Tieres mithilfe der bakteriellen Tag-codierten flexiblen Titanium (FLX)-Amplikon-Pyrosequenzierung (bTEFAP) und der pilzlichen Tag-codierten FLX-Amplikon-Pyrosequenzierung. In den sechs Proben wurden insgesamt 16 bakterielle Phyla identifiziert, wobei Bacillota (54,55 bis 86,13 %) am dominantesten war, sowie zwei Pilzphyla, wobei Ascomycota (79,64 bis 97,32 %) am vorherrschendsten war. Interessanterweise wurde der pathogene Pilz Candida tropicalis in allen Proben nachgewiesen, was darauf hindeutet, dass die Schildkröte ein Reservoir für zoonotische Pilze sein könnte.
Kommentar von H.-J. Bidmon
Eine weitere Arbeit, die zeigt, dass sowohl Bakterien wie auch Pilze zur normalen Darmflora gehören, wobei es auch zu Unterschieden zwischen den Populationen kommen kann, wie in der Arbeit diskutiert wird. Die Arbeit enthält ausführliche Tabellen, wobei für weiterführende Vergleiche mit früheren Studien auch auf die geänderte Taxonomie verwiesen wird, denn z. B. wurde das das Phylum Bacillota früher unter der Bezeichnung Firmicutes geführt ebenso wie die Pseudomonadota früher als Proteobacteria bezeichnet wurden. Auffällig ist auch bei dieser Studie, dass 4 der Proben von den pathogenen Clostridium dominiert wurden ebenso wurden dabei auch pathogene Pilze nachgewiesen wie Helicobacter sp. und der im Abstract erwähnte Pilz, Candida tropicalis. Hier stellt sich dann auch wieder Frage für welche Spezies oder unter welchen Umständen diese Darmbakterien oder Darmpilze pathogen sind? Siehe dazu auch die jüngst erschienene Arbeit von Liao et al. (2026).
Literatur
Liao, Yuhong, Hao Fu, Ganlin Lv, Huihui Quan, Qing Qiu, Huahua Mao, Jubin Xing, Zirui Wang, Qingman Yang & Xionge Pi (2026): Novel Endogenous Probiotics Enhance Host Intestinal Health, Liver Immune Capacity, Meat Nutritional Composition, and Aquatic Environmental Quality in Pelodiscus sinensis. – Aquaculture Nutrition 2026(1): 7893677 oder Abstract-Archiv.
Galerien
Gopherus polyphemus – Georgia-Gopherschildkröte